行政办公室有高级职称 2名，中级职称2名，硕士研究生1名，在读硕士研究生1名

负责全中心的行政和日常事务管理 , 综合协调各所科室之间的工作,对各项工作进行督促和检查。建立并完善各项规章制度，负责公文、印章使用、档案资料、综合业务、外事等项工作的管理，沟通内外联系。负责来往文电的处理、秘书事务、机要保密、印信管理和文书档案的管理。负责对会议、文件决定事项的落实进行督办、查办及中心值班、 值宿的管理；

组织开展调研工作，负责组织、协调全省各市地疾控中心的业务综合工作。参与重要文稿和文件的草拟工作；协助领导做好战线基本情况调查、战线的专题调查和经验总结，全面掌握全省疾控工作现状，开展全面质量管理与控制在抗击“非典”的战斗中，编撰《全省各地（市）防制 SARS每日工作情况通报》、《省疾病控制中心防制SARS每日工作情况通报》各86期近18万字，为各级政府防治非典工作决策提供了及时准确、科学的决策依据，

2003年7月，黑龙江省委、省政府授予中心办公室“全省防治非典型肺炎工作先进集体承担中国疾病预防控制中心软课《我国突发公共卫生事件应急反应体系的建立》的研究、论证工作，已进入结题阶段